La historia del Colegio empieza a gestarse con la llegada de la Madre María Marcela como fundadora y directora del Hospital San Juan de Dios el 20 de diciembre de 1884. Pide a la Superiora Provincial de Bogotá, Hermanas para abrir un Colegio y llegan las Hermanas Carmen Amalia y Evangelina para principiar las clases. Esto sucede el 31 de Enero de 1890. Más tarde, el 30 de Enero de 1893, fue designada la Madre Amalia para  hacerse cargo del Colegio. Al comienzo fue solo primaria, pero en 1892 ya tiene los grados de bachillerato.

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La primera formación que imparte el Colegio es Pedagogía, luego imparte grados como Expertas en Comercio y más adelante, como ahora, Bachillerato clásico.

De acuerdo a los datos que nos señala la historia hay cuatro modalidades de formación a lo largo de estos 127 o 125 años: Pedagogía, Comercio, Experto en Comercio y Bachillerato Clásico. Hoy Bachillerato Académico con énfasis en Inglés y en Informática.

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Durante este tiempo ha contado con veintiocho directoras o rectoras y ha funcionado en las siguientes sedes: Casa ubicada en la calle 12 con carrera 14, esquina; Carrera 15 No. 16 – 57 con calle 17 No. 15 – 27 (portón) , calle 16 No. 14 -08, el 1 de enero de 1942 el colegio se trasladó al edificio ubicado en la esquina sur occidental del parque de la Independencia, en el año 1956 por el aumento del alumnado, las hermanas alquilaron para la primaria,la casa de propiedad de la parroquia ubicada a espaldas de la catedral; la secundaria continúo en el edificio del parque hasta hasta el 30 de octubre de 1959 y el 25 de Agosto de 1957 se coloca la primera piedra del edificio actual. Al nuevo edificio se trasladó la primaria el 22 de Octubre de 1959 y el 30 de octubre la secundaria.

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Es de anotar que en las primeras décadas del siglo las alumnas recibían clases de piano. En 1930 se recibieron por primera vez niños en el Colegio, en 1957 se creó el  Kinder. En 1964 se graduaron las primeras bachilleres clásicas.

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Es de anotar que en las celebraciones del primer centenario de la llegada de las Hermanas a Colombia las exalumnas entregaron una placa en plata con la inscripción: GRATITUD Y RECONOCIMIENTO DE LAS EXALUMNAS DEL COLEGIO DE LA PRESENTACION 1873 – 1973” SOCORRO SANTANDER.

El 14 de junio 1991 se inauguró la Banda de Honor dirigida por el profesor Nelsón Agón y con la colaboración de la profesora Sabina Salazar. Era necesario que  la celebración del centenario del Colegio 1992, tuviera todo el esplendor que merecían  estos primeros cien años de presencia en la hermosa tarea de formar niños y jóvenes. A través de estos largos veinticinco años, la banda, ha cosechado muchos triunfos, pero especialmente ha creado en las distintas generaciones sentido de pertenencia y valores cívicos.

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Es importante destacar los hitos que marcan el progreso del Colegio tanto en su planta física como en el aspecto académico y de bienestar: En l991 se crea la sección de lavaderos y la enfermería, en 1993 se construye la portería del Colegio y su nueva fachada, en 1994 se constituye la modalidad mixta en el bachillerato,  en 1995 se organiza la sala de Informática y se inicia la elaboración del Proyecto Educativo Institucional con la participación activa de todos los estamentos de la comunidad educativa y se elabora el Manual de Convivencia, en 1996 se otorga a los bachilleres el Título en Énfasis de la Salud  e Informática, este mismo año se crea el departamento de Coordinación Académica y de Disciplina. Pero además se reestructura la Biblioteca y se construyen los Kioskos en el parque infantil.

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Para el Colegio de la Presentación ha sido una fortaleza mantenerse por muchos años en nivel muy superior en las pruebas de estado. Además desde el año 2014 con el convenio firmado con UNO INTERNACIONAL estar a la vanguardia de la tecnología y ser evaluado todos los años, externamente en las pruebas LEXION, AVALÍA  y por la Universidad de CAMBRIDGE, porque esto , le permite dar una formación acorde para el siglo XXI y competir con más de 400 colegios a nivel nacional e internacional.

El Colegio está certificado en Calidad en la norma ISO 9001 -2008, en el momento está haciendo la transición a ISO 9001-2015, esto le exige mantenerse en mejora contínua.

Pero, lo que más cuenta, en la historia institucional es ofrecer una formación plasmada en los valores del Evangelio y en los principios legados por la amada fundadora de la Congregación MARIE POUSSEPIN.